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AI 图鉴

AlphaFold

从氨基酸序列预测蛋白质的三维结构

Google DeepMind 模型 开源

它是什么

AlphaFold 是 Google DeepMind 的蛋白质结构预测系统,第二代(AlphaFold2)在 2020 年 11 月的 CASP14 评测中公布,预测精度接近实验方法。它把蛋白质的氨基酸序列与多序列比对作为输入,用包含注意力机制的 Evoformer 模块建模残基之间的关系,再输出三维坐标。DeepMind 随后开源了代码与模型权重,并与 EMBL-EBI 合作建立 AlphaFold 蛋白质结构数据库,收录了数亿个结构预测。

为什么值得记住

它把蛋白质结构预测做到接近实验水平,并开放代码与权重、建立大规模结构数据库,成为「AI 用于科学研究」最常被引用的案例之一。

关键规格

开放源码
是(代码与模型权重公开)
数据库规模
AlphaFold DB 收录数亿个结构预测
输入
氨基酸序列与多序列比对
发布
2020-11(CASP14)

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